Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRHP20396 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRHP20396 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRHP20396 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRHP20396 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRHP20396 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRHP20396 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRHP20396 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRHP20396 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRHP20396 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRHP20396 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRHP20396 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRHP20396 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRHP20396 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRHP20396 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRHP20396 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRHP20396 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRHP20396 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRHP20396 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRHP20396 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRHP20396 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRHP20396 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRHP20396 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRHP20396 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRHP20396 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRHP20396 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRHP20396 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRHP20396 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRHP20396 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRHP20396 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRHP20396 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRHP20396 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRHP20396 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRHP20396 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRHP20396 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRHP20396 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRHP20396 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRHP20396 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRHP20396 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRHP20396 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRHP20396 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRHP20396 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRHP20396 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRHP20396 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRHP20396 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRHP20396 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRHP20396 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRHP20396 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRHP20396 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRHP20396 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRHP20396 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRHP20396 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRHP20396 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRHP20396 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRHP20396 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRHP20396 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRHP20396 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRHP20396 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRHP20396 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRHP20396 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRHP20396 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRHP20396 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRHP20396 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRHP20396 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRHP20396 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRHP20396 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRHP20396 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRHP20396 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRHP20396 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRHP20396 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRHP20396 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRHP20396 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRHP20396 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRHP20396 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRHP20396 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRHP20396 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRHP20396 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRHP20396 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms