Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB3BP20337 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB3BP20337 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms