Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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PTPRAP18433 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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PTPRAP18433 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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PTPRAP18433 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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PTPRAP18433 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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PTPRAP18433 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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PTPRAP18433 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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PTPRAP18433 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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PTPRAP18433 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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PTPRAP18433 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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