Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms