Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOP1P11387 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TOP1P11387 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TOP1P11387 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TOP1P11387 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TOP1P11387 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TOP1P11387 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TOP1P11387 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP1P11387 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP1P11387 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP1P11387 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP1P11387 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP1P11387 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP1P11387 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP1P11387 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP1P11387 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP1P11387 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP1P11387 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP1P11387 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP1P11387 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP1P11387 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP1P11387 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP1P11387 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP1P11387 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP1P11387 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP1P11387 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP1P11387 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP1P11387 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP1P11387 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP1P11387 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP1P11387 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms