Protein–RNA interactions for Protein: P0C7P2

RFPL3S, Putative protein RFPL3S, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL3SP0C7P2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RFPL3SP0C7P2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.6 ms