Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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