Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGF1P05230 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGF1P05230 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FGF1P05230 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms