Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THY1P04216 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THY1P04216 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
THY1P04216 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
THY1P04216 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
THY1P04216 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
THY1P04216 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
THY1P04216 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
THY1P04216 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
THY1P04216 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THY1P04216 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THY1P04216 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THY1P04216 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THY1P04216 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THY1P04216 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THY1P04216 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THY1P04216 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THY1P04216 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THY1P04216 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THY1P04216 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THY1P04216 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THY1P04216 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms