Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms