Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX4O95219 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX4O95219 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX4O95219 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms