Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UPP2O95045 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
UPP2O95045 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP2O95045 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP2O95045 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP2O95045 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP2O95045 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP2O95045 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP2O95045 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP2O95045 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP2O95045 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP2O95045 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP2O95045 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP2O95045 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP2O95045 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP2O95045 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP2O95045 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP2O95045 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP2O95045 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP2O95045 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP2O95045 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP2O95045 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP2O95045 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP2O95045 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP2O95045 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP2O95045 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP2O95045 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP2O95045 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP2O95045 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP2O95045 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP2O95045 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP2O95045 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP2O95045 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP2O95045 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP2O95045 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP2O95045 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP2O95045 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP2O95045 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP2O95045 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms