Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPLO60437 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPLO60437 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPLO60437 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPLO60437 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPLO60437 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPLO60437 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPLO60437 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPLO60437 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPLO60437 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPLO60437 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PPLO60437 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PPLO60437 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPLO60437 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPLO60437 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPLO60437 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPLO60437 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPLO60437 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPLO60437 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPLO60437 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPLO60437 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPLO60437 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPLO60437 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPLO60437 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPLO60437 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPLO60437 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPLO60437 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PPLO60437 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPLO60437 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPLO60437 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPLO60437 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPLO60437 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPLO60437 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPLO60437 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PPLO60437 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms