Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKNO60260 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKNO60260 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKNO60260 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKNO60260 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKNO60260 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKNO60260 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKNO60260 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKNO60260 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKNO60260 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKNO60260 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKNO60260 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKNO60260 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKNO60260 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKNO60260 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKNO60260 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKNO60260 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKNO60260 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRKNO60260 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRKNO60260 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRKNO60260 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRKNO60260 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRKNO60260 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRKNO60260 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKNO60260 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms