Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB3O43889 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB3O43889 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms