Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ1O43426 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms