Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms