Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRODHO43272 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRODHO43272 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRODHO43272 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRODHO43272 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRODHO43272 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRODHO43272 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRODHO43272 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PRODHO43272 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRODHO43272 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRODHO43272 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRODHO43272 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRODHO43272 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRODHO43272 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRODHO43272 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms