Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF1O43189 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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PHF1O43189 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PHF1O43189 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF1O43189 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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