Protein–RNA interactions for Protein: O15534

PER1, Period circadian protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER1O15534 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PER1O15534 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PER1O15534 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PER1O15534 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PER1O15534 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PER1O15534 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PER1O15534 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PER1O15534 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER1O15534 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER1O15534 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER1O15534 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER1O15534 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER1O15534 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER1O15534 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER1O15534 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER1O15534 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER1O15534 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER1O15534 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER1O15534 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER1O15534 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PER1O15534 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER1O15534 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER1O15534 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER1O15534 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER1O15534 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER1O15534 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER1O15534 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER1O15534 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER1O15534 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER1O15534 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PER1O15534 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PER1O15534 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PER1O15534 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PER1O15534 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PER1O15534 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PER1O15534 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PER1O15534 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PER1O15534 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PER1O15534 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PER1O15534 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PER1O15534 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PER1O15534 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PER1O15534 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PER1O15534 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms