Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCKDKO14874 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCKDKO14874 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms