Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRPO00591 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRPO00591 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms