Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms