Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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