Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E5RI56 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E5RI56 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E5RI56 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E5RI56 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E5RI56 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E5RI56 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E5RI56 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E5RI56 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E5RI56 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E5RI56 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E5RI56 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E5RI56 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E5RI56 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E5RI56 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E5RI56 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E5RI56 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E5RI56 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E5RI56 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E5RI56 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E5RI56 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E5RI56 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E5RI56 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E5RI56 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E5RI56 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E5RI56 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E5RI56 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E5RI56 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E5RI56 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
E5RI56 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E5RI56 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E5RI56 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E5RI56 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E5RI56 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E5RI56 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E5RI56 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E5RI56 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E5RI56 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E5RI56 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E5RI56 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E5RI56 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E5RI56 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E5RI56 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E5RI56 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E5RI56 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E5RI56 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E5RI56 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E5RI56 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E5RI56 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E5RI56 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E5RI56 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E5RI56 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E5RI56 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E5RI56 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E5RI56 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms