Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms