Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms