Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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C9orf172C9J069 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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C9orf172C9J069 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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C9orf172C9J069 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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C9orf172C9J069 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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C9orf172C9J069 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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C9orf172C9J069 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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C9orf172C9J069 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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C9orf172C9J069 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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C9orf172C9J069 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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