Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms