Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRD1A4D1F6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRD1A4D1F6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms