Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms