Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms