Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms