Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms