Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms