Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms