Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms