Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms