Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms