Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRD7Q9NPI1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms