Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP29Q9HBJ7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms