Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX5Q9H2C1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX5Q9H2C1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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