Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFDQ9GZP0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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