Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4CQ9C0C4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms