Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms