Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms