Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms