Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms