Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms