Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms